Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChadO55226 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChadO55226 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChadO55226 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChadO55226 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChadO55226 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChadO55226 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms