Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt5hO55201 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt5hO55201 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms