Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp2a2O55143 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms