Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cyp26a1O55127 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cyp26a1O55127 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms