Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dsg2O55111 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms