Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cxcl13O55038 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cxcl13O55038 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl13O55038 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cxcl13O55038 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl13O55038 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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