Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole2O54956 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole2O54956 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole2O54956 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms