Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1baO35930 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms