Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5r2O35926 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms