Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg3O35902 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg3O35902 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms