Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timm44O35857 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timm44O35857 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms