Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf18O35714 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tnfrsf18O35714 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Tnfrsf18O35714 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf18O35714 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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