Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Notch2O35516 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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