Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms