Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-ObO35424 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms