Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc1O35379 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc1O35379 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms