Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn9O35239 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn9O35239 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms