Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Polr1aO35134 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Polr1aO35134 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Polr1aO35134 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms