Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scarb2O35114 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scarb2O35114 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms