Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn4O35054 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn4O35054 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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