Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Eftud2O08810 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eftud2O08810 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms