Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm19965J3QNY8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm19965J3QNY8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm19965J3QNY8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm19965J3QNY8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm19965J3QNY8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm19965J3QNY8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm19965J3QNY8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm19965J3QNY8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm19965J3QNY8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm19965J3QNY8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm19965J3QNY8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm19965J3QNY8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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