Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim18J3QNP2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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