Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a18J3QN01 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a18J3QN01 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms