Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calhm3J3QMI4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calhm3J3QMI4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms