Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm21818J3KMS6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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