Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21411J3KMS0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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