Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms