Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms