Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r39G3UWE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r39G3UWE6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms