Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ScaperF8VQ70 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ScaperF8VQ70 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms