Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Colca2F8VPY8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Colca2F8VPY8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms