Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rarres1F6ZIS7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms