Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8005F6YKY3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm8005F6YKY3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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