Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Syngap1F6SEU4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syngap1F6SEU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms