Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms