Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cald1E9QA15 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms