Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms