Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Urb2E9Q7L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Urb2E9Q7L1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms