Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FancfE9Q5Z5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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FancfE9Q5Z5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FancfE9Q5Z5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms