Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms