Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5430401F13RikE9Q328 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms