Protein–RNA interactions for Protein: E9Q101

Gm6034, Predicted gene 6034, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6034E9Q101 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6034E9Q101 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms