Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8159E9Q0R1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms