Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E9Q0B3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9Q0B3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms