Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Parp4E9PYK3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms