Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc175E9PVB3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc175E9PVB3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms