Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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