Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FgaE9PV24 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms