Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm43720E0CXM8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm43720E0CXM8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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